
С момента первого поражения Захватчиков прошло тридцать два года. A.E.G.I.S. уже практически расформирована и превратилась в подпольную организацию, в которой осталось лишь несколько Хранителей Врат, призванных спасти человечество. Одна из членов организации, Аянэ Исудзу, устала от общества в целом, хотя и продолжает побеждать Захватчиков из злости на своего отца. Неожиданно она узнает о возрождении Генерала Машин (Кикай Сёгун) и Графа Дьявола (Акума Хакушаку), но теперь их сопровождает таинственная девушка-призрак. Аяне и остаткам A.E.G.I.S предстоит остановить их и вновь спасти человечество.